| Titre : |
FACTEURS D'EMERGENCE DE DEUX FLA VIVIRUS (ZIKA et DENGUE) A POTENTIEL EPIDEMIQUE EN AFRIQUE |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Oumar Faye, Auteur |
| Editeur : |
Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Biologie animale |
| Année de publication : |
2009 |
| Importance : |
117 P. |
| Format : |
29 cm |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
flavivirus virus Zika zika virus dengue dengue évolution moléculaire diagnostic RT-PCR rt-pcf aedes aegypti variabilité moléculaire |
| Résumé : |
Les virus Zika (VZIK) et Dengue (VDEN) sont des arbovirus des zones tropicales qui appartiennent à la famille
des Flaviviridae, au genre Flavivirus. Ils partagent des caractéristiques similaires du point de vue taxonomique et
du cycle de transmission. Le tableau clinique de ces virus varie de la forme asymptomatique ou bénigne (dengue
fébrile) pour les VZIK et VDEN, qui peut évoluer vers une des formes sévères (dengue hémorragique ou choc)
avec une issue fatale pour le VDEN.
De 1968 à 2002, une circulation régulière du VZIK est rapportée au Sénégal et en Afrique de l’Ouest. A ce jour
une seule étude est disponible sur l’évolution moléculaire du VZIK. C’est ainsi que nous avons exploré les taux
de substitution, l’évolution, les dates de divergences et la migration de 37 souches du VZIK d’Afrique de l’Ouest
isolées de 1968 à 2002 à partir de séquences partielles et complète du génome viral afin de comprendre son
épidémiologie.
Deux méthodes RT-PCR (classique et temps réel) ont été aussi mises au point du fait du manque de rapidité et de
l’interprétation difficile des méthodes actuelles de détection du VZIK. Les performances des méthodes
développées ont été évaluées. L’alignement des séquences de l’enveloppe a révélé l’absence du site de
glycosylation, Asn-153, conservé chez les flavivirus, pour une souche du Sénégal et une délétion du motif
IGHETDE en amont de l’Asn-153 pour une souche de Centrafrique. L’analyse phylogénétique a révélé une
répartition spatiotemporelle du VZIK avec deux lignées dont l’une regroupant des souches anciennes et récentes
isolées du VZIK de 1968 à 2002 du Sénégal, de la Côte d’Ivoire, du Burkina Faso et de la Centrafrique et l’autre
regroupant des souches du Sénégal de 1998 et de 2001 essentiellement isolées du moustique Aedes dalzieli.
L’analyse des génomes partiels et complets a mis en évidence des souches recombinantes du VZIK montrant une
co-circulation de plusieurs souches. Le VZIK circulerait en Afrique de l’Ouest il y a environ 325 ans. Le VZIK
serait introduit en Côte d’Ivoire à partir du Sénégal. Le moustique Aedes luteocephalus a contribué à la
distribution du VZIK aux autres espèces étudiées. Aucune réaction croisée avec les autres flavivirus n’a été
observée avec les deux techniques RT-PCR mises au point. Les limites de détection ont été de 7,7 PFU/réaction
et 96 copies/réaction respectivement pour la RT-PCR classique et temps réel. Ces techniques, applicables au
diagnostic différentiel, permettront d’étendre le panel de virus à tester en cas de suspicion d’arbovirose.
Au Sénégal et en Afrique, les épidémies de dengue sont rares et la dengue hémorragique est quasi inexistante
malgré la circulation du virus et de son vecteur épidémique Aedes aegypti. Afin de comprendre le rôle du
moustique dans l’épidémisation du virus de la dengue 2, la variabilité génétique sur la totalité de la protéine E
d’une souche selvatique du VDEN - 2 a été suivie par des techniques moléculaires chez des moustiques Aedes
aegypti infectés par voie orale (VO) et intrathoracique (IT). Une conservation de la souche selvatique du VDEN-
2 au cours du processus d’infection IT a été observée mais elle est différente au niveau du site de glycosylation,
l’Asn-153, après son passage expérimental par VO. Cette mutation suggère une pression de sélection au cours du
passage du virus par VO chez la population de moustique étudiée. |
| Permalink : |
https://bibliothequefst.ucad.sn/index.php?lvl=notice_display&id=847 |
FACTEURS D'EMERGENCE DE DEUX FLA VIVIRUS (ZIKA et DENGUE) A POTENTIEL EPIDEMIQUE EN AFRIQUE [texte imprimé] / Oumar Faye, Auteur . - Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Biologie animale, 2009 . - 117 P. ; 29 cm. Langues : Français ( fre)
| Mots-clés : |
flavivirus virus Zika zika virus dengue dengue évolution moléculaire diagnostic RT-PCR rt-pcf aedes aegypti variabilité moléculaire |
| Résumé : |
Les virus Zika (VZIK) et Dengue (VDEN) sont des arbovirus des zones tropicales qui appartiennent à la famille
des Flaviviridae, au genre Flavivirus. Ils partagent des caractéristiques similaires du point de vue taxonomique et
du cycle de transmission. Le tableau clinique de ces virus varie de la forme asymptomatique ou bénigne (dengue
fébrile) pour les VZIK et VDEN, qui peut évoluer vers une des formes sévères (dengue hémorragique ou choc)
avec une issue fatale pour le VDEN.
De 1968 à 2002, une circulation régulière du VZIK est rapportée au Sénégal et en Afrique de l’Ouest. A ce jour
une seule étude est disponible sur l’évolution moléculaire du VZIK. C’est ainsi que nous avons exploré les taux
de substitution, l’évolution, les dates de divergences et la migration de 37 souches du VZIK d’Afrique de l’Ouest
isolées de 1968 à 2002 à partir de séquences partielles et complète du génome viral afin de comprendre son
épidémiologie.
Deux méthodes RT-PCR (classique et temps réel) ont été aussi mises au point du fait du manque de rapidité et de
l’interprétation difficile des méthodes actuelles de détection du VZIK. Les performances des méthodes
développées ont été évaluées. L’alignement des séquences de l’enveloppe a révélé l’absence du site de
glycosylation, Asn-153, conservé chez les flavivirus, pour une souche du Sénégal et une délétion du motif
IGHETDE en amont de l’Asn-153 pour une souche de Centrafrique. L’analyse phylogénétique a révélé une
répartition spatiotemporelle du VZIK avec deux lignées dont l’une regroupant des souches anciennes et récentes
isolées du VZIK de 1968 à 2002 du Sénégal, de la Côte d’Ivoire, du Burkina Faso et de la Centrafrique et l’autre
regroupant des souches du Sénégal de 1998 et de 2001 essentiellement isolées du moustique Aedes dalzieli.
L’analyse des génomes partiels et complets a mis en évidence des souches recombinantes du VZIK montrant une
co-circulation de plusieurs souches. Le VZIK circulerait en Afrique de l’Ouest il y a environ 325 ans. Le VZIK
serait introduit en Côte d’Ivoire à partir du Sénégal. Le moustique Aedes luteocephalus a contribué à la
distribution du VZIK aux autres espèces étudiées. Aucune réaction croisée avec les autres flavivirus n’a été
observée avec les deux techniques RT-PCR mises au point. Les limites de détection ont été de 7,7 PFU/réaction
et 96 copies/réaction respectivement pour la RT-PCR classique et temps réel. Ces techniques, applicables au
diagnostic différentiel, permettront d’étendre le panel de virus à tester en cas de suspicion d’arbovirose.
Au Sénégal et en Afrique, les épidémies de dengue sont rares et la dengue hémorragique est quasi inexistante
malgré la circulation du virus et de son vecteur épidémique Aedes aegypti. Afin de comprendre le rôle du
moustique dans l’épidémisation du virus de la dengue 2, la variabilité génétique sur la totalité de la protéine E
d’une souche selvatique du VDEN - 2 a été suivie par des techniques moléculaires chez des moustiques Aedes
aegypti infectés par voie orale (VO) et intrathoracique (IT). Une conservation de la souche selvatique du VDEN-
2 au cours du processus d’infection IT a été observée mais elle est différente au niveau du site de glycosylation,
l’Asn-153, après son passage expérimental par VO. Cette mutation suggère une pression de sélection au cours du
passage du virus par VO chez la population de moustique étudiée. |
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