DETECTION ET CARACTERISATION MOLECULAIRE DES ENTEROVIRUS : CAS D’UNE POPULATION PEDIATRIQUE DE L’HÔPITAL NATIONAL D’ENFANT ALBERT ROYER DE FANN (CHNEAR) / Sékou CISSE (2024) 

Public ISBD Titre : DETECTION ET CARACTERISATION MOLECULAIRE DES ENTEROVIRUS : CAS D’UNE POPULATION PEDIATRIQUE DE L’HÔPITAL NATIONAL D’ENFANT ALBERT ROYER DE FANN (CHNEAR) Type de document : texte imprimé Auteurs : Sékou CISSE, Auteur Editeur : Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Mathématiques-Informatique Année de publication : 2024 Importance : 1vol.(54p.) Présentation : 30cm. Format : PDF Langues : Français (fre) Mots-clés : Entérovirus  Virus  Virus à ARN  Molécule  Gastro-entérite infantile  Systeme digestif  Inflammation  Diarrhées  Prévalence  Pédiatrie  Centre Hospitalier National  Albert Royer  Fann  Dakar  Sénégal. Résumé : Les entérovirus sont des virus très répandus dans le monde entier, provoquant un large éventail de maladies chez les enfants et les adultes. Il est important de connaître la prévalence mondiale des EV pour définir leur signification clinique et la charge totale de morbidité, et cela aide à prendre des décisions thérapeutiques. Bien que de nombreuses études aient été menées pour décrire l’épidémiologie EV dans des populations spécifiques et des cohortes de patients, peu d’efforts ont été déployés pour regrouper les preuves disponibles. Au Sénégal l’introduction du vaccin Rotarix en 2014 a diminué considérablement l’infection d’EV non poliomyélites comme le rotavirus [3]. Toutefois, les diarrhées à gastroentérite demeurent encore l’une des principales causes de consultation en pédiatrie. C’est dans ce contexte que s’inscrit notre étude ; qui avait pour objectif la recherche et la caractérisation moléculaire des EV chez les enfants atteints de gastroentérite venus en consultation ou hospitalisés au CHNEAR de Dakar. Cette étude pilote nous permit d’évaluer la présence des EV à partir de 113 d'échantillons de selles prélevés auprès d'enfants atteints de gastro-entérite sur la période allant du 04 janvier et le 26 juin 2021. À noter que dans le cadre des analyses de routine et de surveillance, ces échantillons avaient préalablement fait l’objet de recherche de parasites, de bactéries et de rotavirus ; qui dans tous les cas étaient négatifs. Sur le total de prélèvements de selles collectés, deux ont été constatés positives à la RT-PCR. Nos données de séquençage ont révélé la présence à partir d’un échantillon un EVB-B avec une prévalence de 1,8%. L’analyse phylogénétiques a démontré une ressemblance de notre séquence avec les différentes séquences détectées au Sénégal et d’autres régions en Afrique. En effet, elle est à 90% vraisemblable à l’Echovirus E6 détecté au Ghana en 2017 [4], de l’Echovirus 11 détecté au Libye en 2012 [5] mais aussi de l’Echovirus E6 du Maroc en 2012 [6]. Cette séquence est aussi apparentée avec le Coxsackievirus CVA 19 de Kaffrine et de Dakar isolée en 2017 [7]. Des études similaires au Sénégal avaient été publiées en 2022 sur la circulation des EV A, B et C [8] mais aussi en 2017 sur l’identification et la caractérisation moléculaire d’EV non poliomyélitiques chez des enfants atteints de paralysie flasque aiguë en Afrique de l’Ouest, 2013-2014 [9]. Nous estimons qu’un train de mesures doit être pris pour réduire les cas de diarrhées infantiles et adapter les nouvelles méthodes de détections des pathogènes en causes au laboratoire. Permalink : https://bibliothequefst.ucad.sn/index.php?lvl=notice_display&id=3758 DETECTION ET CARACTERISATION MOLECULAIRE DES ENTEROVIRUS : CAS D’UNE POPULATION PEDIATRIQUE DE L’HÔPITAL NATIONAL D’ENFANT ALBERT ROYER DE FANN (CHNEAR) [texte imprimé] / Sékou CISSE, Auteur . - Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Mathématiques-Informatique, 2024 . - 1vol.(54p.) : 30cm. ; PDF. Langues : Français (fre) Mots-clés : Entérovirus  Virus  Virus à ARN  Molécule  Gastro-entérite infantile  Systeme digestif  Inflammation  Diarrhées  Prévalence  Pédiatrie  Centre Hospitalier National  Albert Royer  Fann  Dakar  Sénégal. Résumé : Les entérovirus sont des virus très répandus dans le monde entier, provoquant un large éventail de maladies chez les enfants et les adultes. Il est important de connaître la prévalence mondiale des EV pour définir leur signification clinique et la charge totale de morbidité, et cela aide à prendre des décisions thérapeutiques. Bien que de nombreuses études aient été menées pour décrire l’épidémiologie EV dans des populations spécifiques et des cohortes de patients, peu d’efforts ont été déployés pour regrouper les preuves disponibles. Au Sénégal l’introduction du vaccin Rotarix en 2014 a diminué considérablement l’infection d’EV non poliomyélites comme le rotavirus [3]. Toutefois, les diarrhées à gastroentérite demeurent encore l’une des principales causes de consultation en pédiatrie. C’est dans ce contexte que s’inscrit notre étude ; qui avait pour objectif la recherche et la caractérisation moléculaire des EV chez les enfants atteints de gastroentérite venus en consultation ou hospitalisés au CHNEAR de Dakar. Cette étude pilote nous permit d’évaluer la présence des EV à partir de 113 d'échantillons de selles prélevés auprès d'enfants atteints de gastro-entérite sur la période allant du 04 janvier et le 26 juin 2021. À noter que dans le cadre des analyses de routine et de surveillance, ces échantillons avaient préalablement fait l’objet de recherche de parasites, de bactéries et de rotavirus ; qui dans tous les cas étaient négatifs. Sur le total de prélèvements de selles collectés, deux ont été constatés positives à la RT-PCR. Nos données de séquençage ont révélé la présence à partir d’un échantillon un EVB-B avec une prévalence de 1,8%. L’analyse phylogénétiques a démontré une ressemblance de notre séquence avec les différentes séquences détectées au Sénégal et d’autres régions en Afrique. En effet, elle est à 90% vraisemblable à l’Echovirus E6 détecté au Ghana en 2017 [4], de l’Echovirus 11 détecté au Libye en 2012 [5] mais aussi de l’Echovirus E6 du Maroc en 2012 [6]. Cette séquence est aussi apparentée avec le Coxsackievirus CVA 19 de Kaffrine et de Dakar isolée en 2017 [7]. Des études similaires au Sénégal avaient été publiées en 2022 sur la circulation des EV A, B et C [8] mais aussi en 2017 sur l’identification et la caractérisation moléculaire d’EV non poliomyélitiques chez des enfants atteints de paralysie flasque aiguë en Afrique de l’Ouest, 2013-2014 [9]. Nous estimons qu’un train de mesures doit être pris pour réduire les cas de diarrhées infantiles et adapter les nouvelles méthodes de détections des pathogènes en causes au laboratoire. Permalink : https://bibliothequefst.ucad.sn/index.php?lvl=notice_display&id=3758

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