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(2003)
| Titre : |
Caractérisation phénotypique et génotypique des rhizobiums, optimisation du potentiel fixateur d'azote et évaluation de la FBA en milieu naturel chez Pterocarpus erinaceus Poir.(venn) et P. lucens LEPR |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Elhadji Samba Ndao Sylla, Auteur |
| Editeur : |
Dakar : Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Biologie végétale |
| Année de publication : |
2003 |
| Importance : |
100 P. |
| Format : |
29 cm |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
BIOLOGIE VEGETALE Phénotype Génotype Rhizobium Fixation d'azote Pterocarpus erinaceus Pterocarpus lucens Nodulation Mycorhization> Abondance isotopique naturelle Fixation biologique d'azote Fixation biologique Azote |
| Résumé : |
Cinquante isolats comprenant des rhizobiums à croissance lente et des rhizobiums à croissance
rapide nodulant Pterocarpus erinaceus et P. lucens ont été caractérisés. Parmi ces rhizobiums, des
représentants des groupes prédéfinis sur la base de l'analyse numérique des protéines to tales
bactériennes ont été sélectionnés pour la caractérisation génotypique. Les techniques moléculaires
utilisées ont été la PCR-RFLP du gène 16S rDNA, le séquençage du gène16S rDNA et de
l'intergène (IGS) 16S-23S. Les données obtenues ont été comparées entre elles et avec celles
disponibles dans GENBANK. Les résultats obtenus ont permis de disposer d'une banque de
séquences de gènes 16S et IGS 16S-23S rDNA de rhizobiums isolés de Pterocarpus. Les résultats
de l'étude de la diversité génotypique dês- souches de notre collection corroborent ceux obtenus
dans les études phénotypiques. L'analyse des séquences de gènes 16S rDNA et de l'IGS 16S-23S
rDNA montre de manière très précise la différenciation intra et inter générique des groupes de
souches à croissance rapide appartenant aux genres Rhizobium et Mesorhizobium et celles Ã
croissance lente appartenant au genre Bradyrhizobium. Certaines de ces souches à croissance
rapide occupent des positions séparées. Les groupes de souches à croissance lente s'identifient
soit à l'espèce Bradyrhizobium elkanii, soit à l'espèce Bradyrhizobium japonicum. Cependant
parmi ces souches à croissance lente, il y en a une qui ne s'identifie à aucune des espèces connues
du genre Bradyrhizobium.
Une expérience a été menée en serre, dans le but de déterminer l'influence de la double inoculation
rhizobium et endomycorhize ainsi que l'influence du type de sol sur les performances
symbiotiques, la croissance ainsi que la nutrition minérale des jeunes plants de Pterocarpus
erinaceus. Nous avons également utilisé la technique de marquage moléculaire par PCR-RFLP de
l'intergène (IGS) 16S-23S de l' ADN pour mettre en évidence la compétitivité des souches de
rhizobiums ayant servi d'inoculum. Les résultats ont montré que l'inoculation simultanée avec des
souches effectives de rhizobiums et de champignons endomycorhiziens permettait d'accroître de
manière significative les performances symbiotiques des jeunes plants de P. erinaceus. Les effets
positifs de l'inoculation avec les endophytes sur la croissance et la nutrition des jeunes plants de
P. erinaceus étaient plus remarquables sur les sols dont les teneurs en N et P sont les plus faibles.
La comparaison des profils de restriction enzymatique de l'IGS 16S-23S d'ADN extrait de
nodules a révélé la présence de souches de rhizobium natives de certains sols utilisés et qui sont
capables d'infecter les plants de Pterocarpus. La détermination du% d'occupation des nodules
montre que la souche de Bradyrhizobium ORS 206 apparaît comme étant la plus compétitive des
souches infectant dans les nodules.
Le bilan de l'azote fixé par des plants adultes de Pterocarpus lucens a été estimé dans un
écosystème naturel, le Ferla, au Sénégal. La méthode utilisée est celle de l'abondance isotopique
naturelle en 15N (815N). Les investigations ont eu lieu dans deux sites qui se distinguent en
particulier par les caractéristiques du sol. Des ligneux non fixateurs d'azote que 1 on trou e dans
les mêmes aires de répartition que P. lucens ont servi comme plante de référen e. Les résultats ont
montré que les valeurs du 815N sont plus élevées chez les plantes de référence que chez P. lucens.
Par contre, aucune différence significative n' est observée dans les pourcen ages de I total mesuré
entre ces deux types de plantes. Les calculs du % Ndfa chez P lucens ont donné des taux variant
entre 26 et 49%. Ces valeurs relatives varient selon la plante de référence et selon le site. La
contribution de l'N2 dérivé de la FBA chez P. lucens atteint 28 9 kg.N/ha et 10,8 kg.N/ha
respectivement dans les sols ferrugineux et dans les sols sableux.
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| Permalink : |
https://bibliothequefst.ucad.sn/index.php?lvl=notice_display&id=2925 |
Caractérisation phénotypique et génotypique des rhizobiums, optimisation du potentiel fixateur d'azote et évaluation de la FBA en milieu naturel chez Pterocarpus erinaceus Poir.(venn) et P. lucens LEPR [texte imprimé] / Elhadji Samba Ndao Sylla, Auteur . - Dakar : Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Biologie végétale, 2003 . - 100 P. ; 29 cm. Langues : Français ( fre)
| Mots-clés : |
BIOLOGIE VEGETALE Phénotype Génotype Rhizobium Fixation d'azote Pterocarpus erinaceus Pterocarpus lucens Nodulation Mycorhization> Abondance isotopique naturelle Fixation biologique d'azote Fixation biologique Azote |
| Résumé : |
Cinquante isolats comprenant des rhizobiums à croissance lente et des rhizobiums à croissance
rapide nodulant Pterocarpus erinaceus et P. lucens ont été caractérisés. Parmi ces rhizobiums, des
représentants des groupes prédéfinis sur la base de l'analyse numérique des protéines to tales
bactériennes ont été sélectionnés pour la caractérisation génotypique. Les techniques moléculaires
utilisées ont été la PCR-RFLP du gène 16S rDNA, le séquençage du gène16S rDNA et de
l'intergène (IGS) 16S-23S. Les données obtenues ont été comparées entre elles et avec celles
disponibles dans GENBANK. Les résultats obtenus ont permis de disposer d'une banque de
séquences de gènes 16S et IGS 16S-23S rDNA de rhizobiums isolés de Pterocarpus. Les résultats
de l'étude de la diversité génotypique dês- souches de notre collection corroborent ceux obtenus
dans les études phénotypiques. L'analyse des séquences de gènes 16S rDNA et de l'IGS 16S-23S
rDNA montre de manière très précise la différenciation intra et inter générique des groupes de
souches à croissance rapide appartenant aux genres Rhizobium et Mesorhizobium et celles Ã
croissance lente appartenant au genre Bradyrhizobium. Certaines de ces souches à croissance
rapide occupent des positions séparées. Les groupes de souches à croissance lente s'identifient
soit à l'espèce Bradyrhizobium elkanii, soit à l'espèce Bradyrhizobium japonicum. Cependant
parmi ces souches à croissance lente, il y en a une qui ne s'identifie à aucune des espèces connues
du genre Bradyrhizobium.
Une expérience a été menée en serre, dans le but de déterminer l'influence de la double inoculation
rhizobium et endomycorhize ainsi que l'influence du type de sol sur les performances
symbiotiques, la croissance ainsi que la nutrition minérale des jeunes plants de Pterocarpus
erinaceus. Nous avons également utilisé la technique de marquage moléculaire par PCR-RFLP de
l'intergène (IGS) 16S-23S de l' ADN pour mettre en évidence la compétitivité des souches de
rhizobiums ayant servi d'inoculum. Les résultats ont montré que l'inoculation simultanée avec des
souches effectives de rhizobiums et de champignons endomycorhiziens permettait d'accroître de
manière significative les performances symbiotiques des jeunes plants de P. erinaceus. Les effets
positifs de l'inoculation avec les endophytes sur la croissance et la nutrition des jeunes plants de
P. erinaceus étaient plus remarquables sur les sols dont les teneurs en N et P sont les plus faibles.
La comparaison des profils de restriction enzymatique de l'IGS 16S-23S d'ADN extrait de
nodules a révélé la présence de souches de rhizobium natives de certains sols utilisés et qui sont
capables d'infecter les plants de Pterocarpus. La détermination du% d'occupation des nodules
montre que la souche de Bradyrhizobium ORS 206 apparaît comme étant la plus compétitive des
souches infectant dans les nodules.
Le bilan de l'azote fixé par des plants adultes de Pterocarpus lucens a été estimé dans un
écosystème naturel, le Ferla, au Sénégal. La méthode utilisée est celle de l'abondance isotopique
naturelle en 15N (815N). Les investigations ont eu lieu dans deux sites qui se distinguent en
particulier par les caractéristiques du sol. Des ligneux non fixateurs d'azote que 1 on trou e dans
les mêmes aires de répartition que P. lucens ont servi comme plante de référen e. Les résultats ont
montré que les valeurs du 815N sont plus élevées chez les plantes de référence que chez P. lucens.
Par contre, aucune différence significative n' est observée dans les pourcen ages de I total mesuré
entre ces deux types de plantes. Les calculs du % Ndfa chez P lucens ont donné des taux variant
entre 26 et 49%. Ces valeurs relatives varient selon la plante de référence et selon le site. La
contribution de l'N2 dérivé de la FBA chez P. lucens atteint 28 9 kg.N/ha et 10,8 kg.N/ha
respectivement dans les sols ferrugineux et dans les sols sableux.
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Thèse de doctorat d'Etat |
Thèses biologie végétale |
Biotechnologie végétales et microbiennes
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TH 855
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