| Titre : |
Diversité génétique des entérovirus non poliomyélitiques circulant au Sénégal de 2013 à 2021 |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Ndack NDIAYE, Auteur |
| Editeur : |
Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Biologie animale |
| Année de publication : |
2024 |
| Importance : |
178 P. |
| Format : |
29 cm. |
| Note générale : |
These provisoire |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
Enterovirus entérovirus non poliomyélitique paralysie flasque aiguë épidémiologie moléculaire sante communautaire environnement diversité génétique eau usée culture cellulaire selle échantillon étiologie virale senegal afrique. |
| Résumé : |
Plusieurs facteurs peuvent être à l’origine d’une paralysie flasque aiguë (PFA) notamment les entérovirus
non poliomyélitiques (ENP). Au Sénégal, très peu d’études visant à identifier de façon spécifique les ENP,
ont été réalisées et les premières conduites ont montré une grande diversité d’ENP circulant dans le pays. Ce
travail a pour objectif d’étudier l’épidémiologie moléculaire des ENP au Sénégal de 2013 à 2021, y compris
ceux émergent et/ou ré-émergent comme l'entérovirus A71 (EV-A71) et l'entérovirus D68 (EV-D68). Le
recrutement a été effectué à travers une surveillance des cas de PFA et une surveillance environnementale
(SE) dans les eaux usées.
Un total de 3815 échantillons de selles et 281 échantillons d’eaux usées ont été recueillies. Après isolement
viral par culture cellulaire, les isolats d’ENP ont été confirmés par qRT-PCR. Á la suite de cette détection,
les échantillons positifs ont fait l’objet d’une caractérisation moléculaire.
Les résultats obtenus montrent que 15,23 % et 52,66 % et ont été positifs pour les ENP dans la surveillance
des cas de PFA et dans la SE respectivement. Ces ENP ont été détectés durant toutes les années avec des pics
épidémiques irréguliers. Le groupe d’âge de 0 à 5 ans ont été les plus vulnérable aux infections à ENP
(84,4%). La caractérisation moléculaire a révélé une circulation des 4 espèces d’EV humain: EV-A (29,2%),
EV-B (63,1%), EV-C (5,3%) et EV-D (2,4%). L’analyse des séquences du gène VP1 a également confirmé
la circulation de ces 4 espèces. Tous les entérovirus émergent et/ou ré-émergent provenaient de la
surveillance des cas de PFA majoritairement durant l’année 2016. Ils appartenaient au sous-génotype C1 et
C2 pour l'EV-A71 et au sous-clade B3 nouvellement définie pour l'EV-D68.
Nos résultats montrent que les ENP occupent une place importante dans l'étiologie virale des PFA au Sénégal
et soulignent la nécessité de formuler des stratégies efficaces à long terme pour surveiller les infections à
ENP en Afrique et au Sénégal en particulier. |
| Permalink : |
https://bibliothequefst.ucad.sn/index.php?lvl=notice_display&id=1766 |
Diversité génétique des entérovirus non poliomyélitiques circulant au Sénégal de 2013 à 2021 [texte imprimé] / Ndack NDIAYE, Auteur . - Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Biologie animale, 2024 . - 178 P. ; 29 cm. These provisoire Langues : Français ( fre)
| Mots-clés : |
Enterovirus entérovirus non poliomyélitique paralysie flasque aiguë épidémiologie moléculaire sante communautaire environnement diversité génétique eau usée culture cellulaire selle échantillon étiologie virale senegal afrique. |
| Résumé : |
Plusieurs facteurs peuvent être à l’origine d’une paralysie flasque aiguë (PFA) notamment les entérovirus
non poliomyélitiques (ENP). Au Sénégal, très peu d’études visant à identifier de façon spécifique les ENP,
ont été réalisées et les premières conduites ont montré une grande diversité d’ENP circulant dans le pays. Ce
travail a pour objectif d’étudier l’épidémiologie moléculaire des ENP au Sénégal de 2013 à 2021, y compris
ceux émergent et/ou ré-émergent comme l'entérovirus A71 (EV-A71) et l'entérovirus D68 (EV-D68). Le
recrutement a été effectué à travers une surveillance des cas de PFA et une surveillance environnementale
(SE) dans les eaux usées.
Un total de 3815 échantillons de selles et 281 échantillons d’eaux usées ont été recueillies. Après isolement
viral par culture cellulaire, les isolats d’ENP ont été confirmés par qRT-PCR. Á la suite de cette détection,
les échantillons positifs ont fait l’objet d’une caractérisation moléculaire.
Les résultats obtenus montrent que 15,23 % et 52,66 % et ont été positifs pour les ENP dans la surveillance
des cas de PFA et dans la SE respectivement. Ces ENP ont été détectés durant toutes les années avec des pics
épidémiques irréguliers. Le groupe d’âge de 0 à 5 ans ont été les plus vulnérable aux infections à ENP
(84,4%). La caractérisation moléculaire a révélé une circulation des 4 espèces d’EV humain: EV-A (29,2%),
EV-B (63,1%), EV-C (5,3%) et EV-D (2,4%). L’analyse des séquences du gène VP1 a également confirmé
la circulation de ces 4 espèces. Tous les entérovirus émergent et/ou ré-émergent provenaient de la
surveillance des cas de PFA majoritairement durant l’année 2016. Ils appartenaient au sous-génotype C1 et
C2 pour l'EV-A71 et au sous-clade B3 nouvellement définie pour l'EV-D68.
Nos résultats montrent que les ENP occupent une place importante dans l'étiologie virale des PFA au Sénégal
et soulignent la nécessité de formuler des stratégies efficaces à long terme pour surveiller les infections à
ENP en Afrique et au Sénégal en particulier. |
| Permalink : |
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