| Titre : |
Epidémiologie du Covid-19 et analyse de la valeur du cycle threshold au Service d’accueil des Urgences de l’Hôpital militaire de Ouakam |
| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Ibrahima Gueye, Auteur |
| Editeur : |
Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Mathématiques-Informatique |
| Année de publication : |
2022 |
| Importance : |
48 P. |
| Format : |
29 cm. |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
Covid-19 Epidémiologie contamination cas communautaire detresse respiratoire syndrome test PCR cycle evolutif threshold detection diagnostic hopital militaire ouakam dakar senegal cycle threshold BioInformatique BioMathématique |
| Résumé : |
Le diagnostic du Covid-19 se fait par test RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymérase Chain Réaction) avec un seuil de détection. Le nombre d’amplifications qu’il faut pour atteindre ce seuil de détection est appelé Ct (cycle threshold). Ainsi, la question fondamentale que nous nous sommes posés est de savoir si la pathogénicité dépendait du Ct. Notre étude a été menée à l’hôpital militaire de Ouakam (HMO). Le recrutement des patients a été réalisé au niveau du service d’accueil des urgences (SAU) médico-chirurgicales et la réalisation des tests à l’unité de biologie moléculaire de l’Hôpital militaire de Ouakam. Il s’est agi d’une étude transversale et descriptive réalisée du 25 Octobre 2021 au 7 Mars 2022.
Les données ont été saisies et traitées à l'aide du logiciel EPI info 7.2 et présentées sous forme de tableau à l'aide des logiciels Word et Excel du progiciel Office 2010. Durant la période d’étude, 1750 patients ont présenté des symptômes du covid-19 dont 439 qui ont été déclarés positifs. L’âge moyen était de 38,49 ans (extrêmes 5–85 et l’écart-type 15.86). Le Sex-ratio chez les patients Covid-19 est de 1,37. Au cours de la période d’étude, 1750 patients étaient soumis au test PCR et antigénique pour le SARS-CoV-2 dont 439 sont revenus positive. Soit un taux de positivité de 38,5%. La moyenne du Ct parmi les positifs ayant bénéficié du test PCR était de 18,7 (20,72 chez les femmes et 16,97 chez les hommes). Dans le cadre d’une étude transversale, descriptive et analytique menée du 1er juin 2020 au 30 septembre 2021, menée au Centre de Traitement des Epidémies (CTE) du Centre Hospitalier Abas NDAO, la valeur moyenne de Ct dans le groupe de patients ayant développé un syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA +) était de 18,27 (IC 95 % : 17,43-19,10) tandis que pour le groupe (SDRA -) elle était de 33,06 (IC 95 % : 32,77-33,34). Ce qui corrobore la moyenne de 18,7 de Ct trouvée dans notre étude. |
| Permalink : |
https://bibliothequefst.ucad.sn/index.php?lvl=notice_display&id=1649 |
Epidémiologie du Covid-19 et analyse de la valeur du cycle threshold au Service d’accueil des Urgences de l’Hôpital militaire de Ouakam [texte imprimé] / Ibrahima Gueye, Auteur . - Université Cheikh Anta Diop de Dakar : Faculté des Sciences et Techniques : Département de Mathématiques-Informatique, 2022 . - 48 P. ; 29 cm. Langues : Français ( fre)
| Mots-clés : |
Covid-19 Epidémiologie contamination cas communautaire detresse respiratoire syndrome test PCR cycle evolutif threshold detection diagnostic hopital militaire ouakam dakar senegal cycle threshold BioInformatique BioMathématique |
| Résumé : |
Le diagnostic du Covid-19 se fait par test RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymérase Chain Réaction) avec un seuil de détection. Le nombre d’amplifications qu’il faut pour atteindre ce seuil de détection est appelé Ct (cycle threshold). Ainsi, la question fondamentale que nous nous sommes posés est de savoir si la pathogénicité dépendait du Ct. Notre étude a été menée à l’hôpital militaire de Ouakam (HMO). Le recrutement des patients a été réalisé au niveau du service d’accueil des urgences (SAU) médico-chirurgicales et la réalisation des tests à l’unité de biologie moléculaire de l’Hôpital militaire de Ouakam. Il s’est agi d’une étude transversale et descriptive réalisée du 25 Octobre 2021 au 7 Mars 2022.
Les données ont été saisies et traitées à l'aide du logiciel EPI info 7.2 et présentées sous forme de tableau à l'aide des logiciels Word et Excel du progiciel Office 2010. Durant la période d’étude, 1750 patients ont présenté des symptômes du covid-19 dont 439 qui ont été déclarés positifs. L’âge moyen était de 38,49 ans (extrêmes 5–85 et l’écart-type 15.86). Le Sex-ratio chez les patients Covid-19 est de 1,37. Au cours de la période d’étude, 1750 patients étaient soumis au test PCR et antigénique pour le SARS-CoV-2 dont 439 sont revenus positive. Soit un taux de positivité de 38,5%. La moyenne du Ct parmi les positifs ayant bénéficié du test PCR était de 18,7 (20,72 chez les femmes et 16,97 chez les hommes). Dans le cadre d’une étude transversale, descriptive et analytique menée du 1er juin 2020 au 30 septembre 2021, menée au Centre de Traitement des Epidémies (CTE) du Centre Hospitalier Abas NDAO, la valeur moyenne de Ct dans le groupe de patients ayant développé un syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA +) était de 18,27 (IC 95 % : 17,43-19,10) tandis que pour le groupe (SDRA -) elle était de 33,06 (IC 95 % : 32,77-33,34). Ce qui corrobore la moyenne de 18,7 de Ct trouvée dans notre étude. |
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